Vườn Quốc gia Hoàng Liên có khí hậu ôn hòa và dường như lạnh quanh năm. Nhiệt độ tại vườn luôn không quá 20 độ C và không dưới -2 độ C. Thời điểm đẹp nhất để du lịch Vườn Quốc gia Hoàng Liên là sau Tết Nguyên Đán, từ tháng 12 đến tháng 4. Lúc này thời tiết hanh khô, rất thích hợp cho các chuyến trekking hay bộ hành.
Bên cạnh đó thì dù là mùa nào thì nơi đây cũng mang những vẻ đẹp rất riêng. Tuy nhiên, phần chính là để việc di chuyển của du khách thuận lợi nhất. Vậy nên tránh du lịch vào những mùa mưa trong năm để việc di chuyển diễn ra an toàn nhất có thể nhé.